Bajo la influencia de los vientos, las corrientes y los aportes sedimentarios de los ríos, las aguas del Parque Natural Marino ofrecen condiciones especialmente favorables para la biodiversidad.
Aquí están presentes los seis principales ecosistemas mediterráneos, que albergan multitud de especies: fondos arenosos, praderas de posidonia, roca infralitoral, coralígeno, mar abierto y cañones profundos.